Proyecto Química ORT del Genoma Humano

Investigación en bioquímica molecular y proteómica 2008:

(Notese que el blog comienza abajo de todo, y cada nuevo dia se va poniendo encima del otro, quedando el final arriba)
Por cuarto año consecutivo los alumnos del último año de la especialidad Química de la Escuela Técnica ORT Argentina realizarán sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigación con profesionales reconocidos. La metodología de trabajo evita la transpocisión didáctica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se está generando el conocimiento.
La articulación entre el nivel medio y el postgrado universitario es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas). Los 15 proyectos de investigación (incluyendo este) para el año en curso son:

Nuestro Proyecto: Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Doctora Ana María Adamo
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes

1) Proyecto: Evaluación de la expresión de la molecula de adhesión cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumorales.
Investigador: Dra. Mónica Vazquez-Levin.
Instituto: Instituto de Biología y Medicina Molecular (IBYME - CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz Y Gala Szapiro.
Link: http://www.proyecto-6q.blogspot.com/

2) Proyecto: Acción del hexaclorobenceno (HCB) sobre la uroporfirinogeno de una línea celular hepatocitos humanos. Mecanismo de acción.
Investigador: Dra. María del Carmen Ríos de Molina. Instituto: Departamento Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.
Link: http://www.proyectofrid-toiw08.blogspot.com/

3) Proyecto: Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA).
Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.
Link: http://proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Proyecto: Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA.
Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.
Link: http://www.proyectoq08.blogpsot.com/

5) Proyecto: Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman
Link: http://www.scienceproject08.blogspot.com/

6) Proyecto: El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra. Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama
Link: http://www.proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Proyecto: Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin
Link: http://www.vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Proyecto: Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Dpto de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Daniel Averbuj y Eitan Rozenszajn.
Link: http://www.proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Proyecto: Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero
Link: http://www.amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Proyecto: Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik
Link: http://marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Proyecto: Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.
Link: http://www.tarkuselp.blogspot.com/

12) Proyecto: Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales,UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.
Link: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Proyecto: Neovascularizaciòn en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador: Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.
Link: http://finalproyectort.blogspot.com/

14) Proyecto: Interacción de sumo-1 y mage-a2 en la regulacion del oncosupresor p53.
Investigador: -
Instituto: -
Alumnos: Yair Litman y Leonel Sterman
Link: http://proyectosumo.blogspot.com/

jueves, 14 de agosto de 2008

Día 7: Electroforesis

Se evaluó la presencia de los plásmidos mediante una electroforesis en un gel de agarosa 1% (0,5gr de agarosa, 50ml de buffer TBE [2,7gr Tris, 1,3075 de ácido bórico, 1ml de EDTA 0,5 molar pH 8]) y 4μl de Bromuro de Etidio.


Se observó la presencia de ambos plásmidos en las preparaciones evaluadas.Las bandas correspondientes a los plásmidos fueron visualizadas con bromuro de etidio que emite fluorescencia cuando se ilumina con luz ultravioleta.

Día 6: Obtención del plásmido para su control II

Luego del cultivo, se observó que las bacterias transformadas con el plásmido YN-Ub se multiplicaron como se esperaba mientras que no hubo desarrollo de las bacterias transformadas con el plásmido Jun-CFP. Con estos resultados decidimos repetir la transformación de las bacterias con el plásmido Jun-CFP.
Posteriormente, tomamos 1,5 ml de cada uno de los cultivos de las bacterias que crecieron correctamente (YN-Ub) y la centrifugamos a 10000 x g durante 2 minutos.

Preparamos una mezcla de buffer Telt conteniendo Lisozima, usamos 10 ul Lisozima y 90 ul de telt por tubo, y se la agregamos a las suspensiones de bacterias, luego agitamos utilizando un vortex para lograr una buena resuspensión.




Luego seguimos el siguiente procedimiento:

Dejamos las muestras 5 minutos a temperatura ambiente.
Hervimos las muestras durante 1 minuto.
Las dejamos en hielo por 2 minutos.
Centrifugamos 15 minutos a 10000 x g.
Recogimos el sobrenadante.
Agregamos 1 volumen equivalente de isopropanol.
Las dejamos 20 minutos a temperatura ambiente.
Centrifugamos durante 20 minutos a 10000 x g y descartamos el sobrenadante.
Agregamos 10 ul de EtOH 70% (v/v).
Centrifugamos 5 minutos a 10000 x g.

En ese momento nos teníamos que ir y Karina terminó de secar las muestras al vacío y las resuspendió en 10 ul de agua estéril.

Se conservaron las muestras a -20ºC hasta la semana siguiente.

Día 5: Obtención del plásmido para su control I

Sacamos las placas y observamos los resultados.

Se observaron colonias en las placas con las bacterias transformadas con el plásmido YN-Ub pero solo unas pocas colonias dispersas se observaron en las placas con las bacterias transformadas con el plásmido Jun-CFP.

Seleccionamos 2 colonias aisladas de cada placa, las colocamos en el medio de cultivo LB con el ATB correspondiente en cada caso y las dejamos incubando over-night a 37ºC.